Desde 1945 - 1950 Rotblat fue el encargado de la física nuclear en Él estaba tan horrorizado por el uso de armas nucleares contra las ciudades japonesas de Hiroshima y Nagasaki que dedicó su energía para el desarrollo de Liverpool.
aplicaciones médicas que utilizan la radiación nuclear. En colaboración con Chadwick, se encontró que los isótopos radiactivos de yodo y fósforo para tener una aplicación útil. Además, colaboró con George Ansell en el desarrollo del uso de yodo radiactivo para el tratamiento de problemas de la tiroides, un protocolo de tratamiento . utilizado para este día Él continuó este tipo de trabajo - aplicación beneficiosa de su conocimiento de la física nuclear - en el Colegio Médico de Bartolomé, donde trabajó durante veinte y seis años a partir de 1949.
En las noticias del bombardeo atómico de Hiroshima, Rotblat fue devastada, porque él tenía la esperanza de que el arma no iba a funcionar o que se utilizaría como un proyecto de demostración con el fin de mostrar a los japoneses lo terrible de esta arma. Creía firmemente que los científicos no deberían participar en el desarrollo y la proliferación de armas nucleares. En 1946, fundó la Asociación de Científicos Atómicos (ASA) para estimular el debate público en torno a la cuestión de las armas nucleares.
La asociación tenía una agenda no política orientada a educar al público sobre los usos pacíficos de la radiactividad.
Rotblat estableció una relación con Bertrand Russell. El 23 de diciembre de 1954, Russell hizo una emisión de radio destacando los peligros de las pruebas nucleares; él estaba firme en su convicción de que los científicos deben tomar la iniciativa de informar a la opinión pública. Con este fin, convenció a Einstein para ayudar a redactar un manifiesto. El Manifiesto Russell-Einstein (ver folleto) fue firmado por diez científicos incluyendo Rotblat. Rotblat fue incansable en sus esfuerzos para llamar la atención sobre los peligros de las armas nucleares y las pruebas nucleares. Estableció las conferencias Pugwash que en última instancia tenían veintidós participantes, de alcance in
El polémico proyecto de ley 183