Al llegar al Palacio Nacional declinó el honor de sentarse en la silla presidencial, que dio en honor de Francisco Villa. En la capital no iba a durar mucho tiempo. Sin la comprensión de la compleja maquinaria del poder nacional, las fuerzas convencionales evacuaron voluntariamente. Carranza la recuperó sin disparar un tiro. Su gobierno, por su parte, con sede en Veracruz, un proyecto de ley agrícola de hecho emitió el 06 de enero 1915, incluyendo dos puntos de la restitución y la distribución de la tierra.
Fin de Zapata diferencia de Villa, Zapata nunca tuvo un ejército profesional en línea, listo para las grandes batallas. Sus soldados eran campesinos, miembros de la comunidad, que dejaron la pistola tan pronto tomó el arado. Su fuerza era más moral que material. En 1916, Carranza se reinstaló en la ciudad de México, de la que lideró la ofensiva contra el Centauro del Norte a través de General Álvaro Obregón. Villa derrotó, de facto, a cargo del Poder Ejecutivo organizó el ataque a Zapata, bajo el mando del general Pablo González. El 2 de mayo se inició el ataque.
72 horas en casi todas las poblaciones de la región cayeron en sus manos. Fue confinado a los prisioneros en campos de concentración, cientos se tiran, quemaron pueblos enteros, y los ganadores y oficiales involucrados en el saqueo, saqueo casas y granjas y abigeato y maquinaria. Sin embargo, no tenía la malaria, que, aliado con la guerrilla zapatista, lo que obligó a evacuar la zona a finales de diciembre. El 01 de mayo 1917 Carranza asumió constitucionalmente la presidencia de la república, y con la autorización del Congreso, se propuso eliminar Zapata.
Esta vez no sólo delante sino también mediante el uso de engaño y traición. En primer lugar, los espías y provocadores para penetrar en la región zapatista, y luego envió tropas a Pablo González capturó insurgente en la zona de nuevo. En octubre de ese año, Zapata se convirtió de nuevo en un fugitivo. Esta condi