En los niños el proceso estándar es retrasar el inicio de la pubertad a través del uso de hormonas durante unos años en la adolescencia con el fin de permitir que el niño madure mentalmente. Si el niño tiene ahora suficiente madurez, capacidad de toma de decisiones independientes, y aún identifica y desea convertirse en el género opuesto, la terapia hormonal de reasignación de género puede comenzar.
La asesoría puede ser considerada como una alternativa si la reasignación de género es inaceptable o si es posible que el adulto o niño está simplemente pasando por una "fase".